1) பெருந்தொகை தற்செயலாகத் sequencing முறை மனிதக் pieces, பாக்டீரியாவின், எங்கே அந்த பகுதியைத் முதலில் வந்தது, எந்த foreknowledge கொண்டு sequenced. இது முடியும் இருக்க contrasted கொண்டு "இயக்கிய" சுரண்டல், அதில் இருந்து தெரிந்த chromosomal இருப்பிடங்களை டிஎன்ஏ pieces ஆகியவை sequenced. இரு வழிமுறைகள் நன்மைகள் உள்ளன, ஏனென்றால் ஆய்வாளர்கள் பயன்படுத்த இரண்டும் தொடர்பற்ற (அல்லது ஷாட்கன்) மற்றும் மனித பாக்டீரியாவின் வரிசை முறை ஒன்றினைந்து உத்திகளும் உத்தரவிட்டது.

2) ஷாட்கன் sequencing தீர்மானிக்கிறது, ஒரு உயிரிக்கு பாக்டீரியாவின் டிஎன்ஏ வரிசைமுறையை க்கான ஒரு ஆய்வகம் தொழில்நுட்பம் உள்ளது. முறை க்குள் தனித்தனியாக sequenced என்று சிறிய டிஎன்ஏ fragments தொகுப்பை பாக்டீரியாவின் வெட்டு நிலையைக் கொண்டுள்ளது. ஒரு கணினி நிரல் உள்ள டிஎன்ஏ தொடர்கள் overlaps தேடும் மற்றும் தனி fragments பாக்டீரியாவின் reconstitute செய்ய தங்களது சரியான வரிசையில் வைக்க அவற்றை பயன்படுத்தும்.